La gestion des droits basée sur les rôles permet de définir les possibilités d'accès à différents domaines de l'administration système de PepperShop.
Il existe un contrôle d'accès complet pour la plupart des points de navigation dans l'administration et pour chaque module. Pour quelques autres masques, des contrôles de droits plus étendus sont également disponibles - par exemple pour le tableau de bord.